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GWAS研究揭示玉米直链淀粉含量的遗传结构


      来自上海交通大学的研究人员发表了题为“The Genetic Architecture of Amylose Biosynthesis in Maize Kernel”的论文,通过全基因组关联分析系统研究了玉米籽粒中表型直链淀粉的含量与单核苷酸多态性的基因型的连锁研究,筛选出了与直链淀粉合成相关的关联SNPs以及有潜力的候选基因,为遗传调控研究玉米淀粉含量和品质改良提供了重要线索。


      这一研究成果公布在Plant Biotechnology Journal杂志上,这项研究由由上海交通大学王文琴与中国科学院上海植物生理生态研究所巫永睿研究组以及沈阳农业大学黄瑞东研究组合作完成,文章的通讯作者为上海交通大学王文琴教授,第一作者为李长生。


      淀粉是玉米籽粒中含量最丰富的碳水化合物,主要包含了25%直链和75%左右的支链淀粉。跟总淀粉含量不同的是,直链和支链淀粉的各自所占的百分含量决定了食品原料和工业应用中不同的加工性能。越来越多的研究兴趣转移到遗传控制单个直链或支链淀粉含量上,而它们生物合成的酶反应机器仍不完全清楚。 


      在这篇文章中,研究人员利用了464株玉米籽粒中表型直链淀粉的含量,以及对应的9,007,194SNPs的基因型,进行连锁不平衡的全基因组关联分析,筛选出了与直链淀粉合成相关的27个SNPs以及有潜力的39个候选基因,这些结果初步阐明了直链淀粉合成的调控网络,对后续研究和改良玉米籽粒具有重要指导意义。 


 (本文转载生物通)


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